Merle Maigre töötab E-riigi Akadeemia küberturvalisuse programmi juhina. Varem töötas ta Eesti ettevõttes CybExer Technologies. Aastatel 2017–2018 oli ta Tallinnas asuva NATO küberkaitse oivakeskuse (NATO CCDCOE) direktor ja 2018–2022 NATO CCDCOE rahvusvahelise nõukoja liige. 2012–2017 töötas ta Eesti presidentide Kersti Kaljulaidi ja Toomas Hendrik Ilvese julgeolekupoliitika nõunikuna. Aastatel 2010–2012 töötas Merle NATO peakorteris NATO peasekretäri erakabineti poliitika planeerimise üksuses. Merle on Euroopa Liidu Võrgu- ja Infoturbeamet (ENISA) nõukoja valitud liige ja USA mõttekoja ning USA mõttekoja Euroopa Poliitikauuringute Keskuse (CEPA) koosseisuväline teadur.
